Consider:Openというサイトで30 Days of Mootools 1.2 TutorialsというMootools初心者向けのチュートリアルがありましたが、本日、日本語訳されたサイトを発見しました。

30日でmootoolsをマスターする初心者向け講座

日本語ドキュメントは高橋さんが日本語訳してくださった1.2系のものがありますが、APIドキュメントと違い、このチュートリアルはデモもあるので、掲載されているソースコードと実際の挙動を確かめながら学習できます。
なので、今からMootoolsを勉強しようと思っている方にはお勧めです。

APIドキュメントに関してはよく書籍で販売されているポケットリファレンス的な利用方法が大きくなると思いますので、ある程度チュートリアルで、Mootoolsの勉強してからの方が理解しやすいと思います。

Mootoolsをもっと知りたい人

JQuery vs Mootools

人気のJavascriptライブラリ、JQueryとMootoolsについてMootools開発メンバーであるAaron Newtonが書いたドキュメントがあります。
これを読むことで、JQueryとMootoolsの違いを理解することができます。
どちらもすばらしいライブラリです。
和訳を高橋さんがされています。
jQuery vs MooTools（和訳）
jQuery vs MooTools（原文）

Mootools Forge

Mootoolsのサードパーティ製プラグインリポジトリです。
githubのリポジトリとアカウントをもっていれば誰でも利用可能です。
たくさんのプラグイン開発者が利用しており、自分専用のプロジェクトページが作成されます。
プラグインの登録は、リポジトリのURLを入力してインポートボタンをクリックして取り込むだけですので、手間がかかりません。
(ただし、必要なパッケージ定義ファイルやディレクトリ構造が決まっています。)
詳しくはこちらをご覧ください。
How to Add a Plugin

これに関しては、日本語での解説を書こうと思います。

Clientcide

Aaron Newtonが作成したプラグインです。
たくさんのプラグインがあり、便利なのでよく使っています。
ドキュメントとデモがあります。
Clientcide

これを気にMootoolsユーザーが増えることを願っています。