軽量で扱いやすいJavaScriptフレームワークMooToolsのVersion 1.2がリリースされた模様です。
また、それに伴いサイトのデザインが変わりました。

以前までは、ダウンロードする際にコア機能をベースに自分で必要なプラグインを選んでダウンロードできる形にっていましたが、コア機能もチューニングできるようになったみたいです。

サイトトップページのDeveloper Toolsの下に下記のようなリンクがあると思います。
・Core Builder
・More Builder

Core BuilderがMooToolsのコア機能のチューニングページで、More Builderがプラグインのチューニングページです。

ダウンロードする場合は、下記のリンクからどうぞ。
http://mootools.net/